S. Andrea in Villis è una piccola frazione ubicata nella zona collinare in sinistra idrografica del T. Arzilla a circa sei chilometri da Fano. Posta a 159 metri s.l.m., gode di una posizione privilegiata, da cui è possibile far correre l'occhio dal'Adriatico fino ai monti del Furlo.
Il nucleo abitato è formato da poche case, in parte di recente costruzione, lungo la strada che da Fenile conduce a Novilara.

Anticamente era denominata S. Andrea in Marenga, poi S. Andrea in Villis per le numerose ville che, soprattutto in passato, esistevano sparse sulla collina.